Olá mundo

Na prestação anterior descrevi a minha viagem de licenciatura para doutoramento, que foi sem dúvida uma etapa satisfatória com muito crescimento pessoal e inúmeras realizações académicas e profissionais. Para a segunda prestação eu vou partilhar o que vivi durante a pandemia, um período muito difícil para toda a humanidade, mas que nos lembra como somos frágeis como todas as outras espécies vivas na Terra.

Vamos a isto!

Etapa 3 _{^{Pandemia e incertezas}}

Começámos em Março de 2020, quando as restrições COVID-19 começaram na maioria dos países e coincidiram com o prazo para a apresentação da minha tese de doutoramento. Além disso, foi o mês em que os fundos da bolsa do meu patrocinador chegou ao fim. Não tendo muitas opções, eu e a minha mulher decidimos deixar Londres e regressar a Bogotá (a minha cidade natal). Apesar de todas as pressões possíveis, cumpri o objectivo de apresentar a minha tese em 30 de Março de 2020 - um dia muito memorável! Depois, em Maio de 2020, defendi a minha tese celebrando remotamente por videochamada com a minha família, supervisores e amigos. Recebi então o meu doutoramento em Geografia do King's College London em Setembro de 2020.

Durante o período da minha tese de correcção e procura de emprego, fui seleccionado para um programa de formação virtual em ciência de dados oferecido pelo governo colombiano e organizado pela Correlation One. Como parte do programa, com outros participantes aplicámos o que aprendemos num projecto centrado no desenvolvimento de modelos e de um painel de dados para prever a reincidência no sistema penal colombiano (ver detalhes aqui ). Posteriormente, em agosto de 2020, tornei-me contratante do Instituto Geográfico Agustín Codazzi, uma entidade governamental colombiana conhecida pelo seu papel na cartografia e planejamento do uso do solo. No meu contrato de 5 meses tive a oportunidade de ser o líder técnico de grupos de 5-6 investigadores e de publicar em revistas científicas os resultados de dois projectos relacionados com a ciência dos dados e tecnologias de inteligência artificial para cartografia de edifícios em zonas rurais (ver detalhes aqui) e cartografia digital do solo (ver detalhes aqui). Também coordenei um desafio do programa de ciência de dados Correlation One que procurou desenvolver modelos preditivos a partir de uma base de dados de solos IGAC (ver repositório aqui).

Com o fim do meu contrato no IGAC e não tendo muito sucesso na procura de opções na academia, decidi enveredar pelo caminho do empreendedorismo. Neste caminho, vale a pena notar que a aprendizagem que recebi num programa extracurricular oferecido pelo instituto de empreendedorismo da minha universidade durante o meu doutoramento foi valiosa. Assim, registei o GeoMagic Labs, uma empresa de consultoria tecnológica de geolocalização, na Câmara de Comércio de Bogotá. Com o meu empreendimento fui seleccionado num concurso de consultoria com a Solidaridad Network, uma ONG focada em facilitar o desenvolvimento de cadeias de fornecimento socialmente responsáveis, ambientalmente sãs e rentáveis. Na minha proposta desenvolvi uma metodologia para mapear sistemas de produção de café utilizando imagens de satélite de acesso aberto (ver detalhes aqui).

Oportunidade 4 - Formação em Ciência de Dados

A ciência de dados ganhou sem dúvida um papel importante nos diferentes domínios do conhecimento com impacto em todos os sectores. Por este motivo, estão disponíveis vários programas e recursos de formação. No meu caso, tirando partido do período de incerteza e virtualidade, estabeleci a tarefa de encontrar formas de melhorar as minhas competências em matéria de ciência de dados. Foi assim que encontrei o programa de Data Science for All (DS4A) de CorrelationOne. Financiado pelo governo colombiano, este programa oferece 13 semanas de formação abertas a todos os cidadãos colombianos que estejam interessados em reforçar as suas competências em matéria de ciência de dados e em aderir ao crescente ecossistema de inteligência artificial na Colômbia. Para participar, é necessário passar um exame de admissão que teste os conhecimentos gerais de estatística, programação e raciocínio lógico. O programa é muito interessante, pois não só recebe formação, mas também tem conversas com profissionais da indústria e do meio acadêmico, contando como eles utilizam a ciência dos dados no seu trabalho diário. Posso descrever o programa como básico ao nível intermédio com exemplos muito práticos e a possibilidade de trabalhar em equipa para pôr todo o conhecimento em prática através de um projecto aplicado proposto por instituições governamentais, pelo sector privado ou por ONG. CorrelationOne ofrece otros programas de entrenamiento enfocados en mujeres, empoderamiento, ingeniería, entre otros que están abiertos a cualquier nacionalidad.

Fase 4 _{^{Ciência Aberta, Maio 2021 - até à data}}

Em novembro de 2020, o regulamento de remissão do meu patrocinador de doutoramento mudou, abrindo as portas a novas oportunidades. Já não era obrigatório provar que eu estava ligado a uma instituição em Bogotá durante o tempo em que recebi financiamento (ou seja, 4 anos!). O novo regulamento foi flexível com outros APAGAR resultados, incluindo a publicação de artigos e/ou o início de um empreendimento relacionado com o tema do doutoramento. Neste novo contexto, candidatei-me a um lugar de pós-doutoramento no Alan Turing Institute no Reino Unido em dezembro de 2020. Já estava familiarizado com o ambiente Turing de uma anterior oportunidade de colaboração hackathon em que participei em dezembro de 2019 (ver o relatório aqui). A posição de pós-doutoramento adequou-se ao meu perfil, e fui atraído pela possibilidade de aprender modelação probabilística, melhorar as competências no desenvolvimento de software e contribuir para Pangeo, uma comunidade que promulga ciência aberta para grandes análises de dados em geociência.

Em fevereiro de 2021 recebi uma comunicação para uma entrevista que incluía uma apresentação de 5 minutos, seguida por uma explicação do código da minha autoria e perguntas do painel da entrevista. Foi a minha primeira entrevista pós-doutoramento, por isso foi natural estar um pouco nervoso. Contudo, dei boas respostas destacando a minha experiência de colaboração em vários grupos de investigação. Na altura de mostrar o meu código, consegui demonstrar como tinha sido utilizado ou visitado em Zenodo (uma plataforma para registar qualquer objecto de investigação digital). Algumas semanas mais tarde, recebi a oferta da posição que começou remotamente a partir de maio de 2021. Mais tarde, com a minha mulher, deixamos a nossa vida em Bogotá e decidimos recomeçar a nossa vida em Londres no final de julho do mesmo ano.

Fazendo parte da Turing, tive a oportunidade de colaborar com vários investigadores no Reino Unido e as suas redes de colaboração, abaixo estão os projetos ou iniciativas com os quais colaboro ativamente:

• O meu projecto de pós-doutoramento envolve o desenvolvimento de ferramentas baseadas na fusão inteligente de dados de sensores ambientais para melhorar a monitorização do nosso planeta em mudança (ver detalhes aqui). Em colaboração com investigadores do British Antarctic Survey e do Met Office estamos a desenvolver uma ferramenta baseada na modelação probabilística que combina dados de diferentes modalidades (dados em grelha, in situ e estações auxiliares) para ter observações mais finas e mais locais das variáveis ambientais. Além disso, com algoritmos gananciosos, a ferramenta é proposta para sugerir onde instalar sensores locais de modo a reduzir a incerteza da variável ambiental modelada. Tenho a sorte de poder contribuir com os meus conhecimentos para o desenvolvimento da ferramenta, no meu caso trabalhando com investigadores do UK Centre for Ecology and Hydrology (UKCEH) para modelar a humidade do solo.
• Sou o fundador e líder do livro "Environmental Data Science" (ver detalhes aqui). É um recurso ambiental liderado pela comunidade onde os cadernos de notas Jupyter são utilizados para demonstrar os avanços em dados, metodologias e outras investigações utilizando ferramentas de código aberto. Através desta iniciativa colaboro com outros membros da comunidade Pangeo na Europa, de modo a aumentar a democratização de ferramentas escaláveis e de código aberto para a geociência.
• Sou membro e desenvolvedor em scivision (ver detalhes aqui), uma ferramenta de código aberto desenvolvida entre investigadores de diferentes domínios, incluindo biologia molecular, agricultura e ambiente, bem como profissionais da equipa de engenharia Turing Research. O meu papel no projecto é assegurar que a ferramenta seja generalizável a uma variedade de imagens (satélite, drones, dados climáticos, entre outros) e modelos da comunidade das ciências ambientais.
• Sou membro e co-líder da equipa de tradução da The Turing Way, uma iniciativa liderada pela comunidade para promover boas práticas em ciência aberta e reprodutível (ver detalhes aqui).

Oportunidade 5 - Comunidades científicas abertas e formação

Para além de melhorar as minhas competências e melhores práticas na programação de aplicações ambientais, a última fase permitiu-me pertencer e contribuir para a comunidade científica aberta. Apesar de ter pertencido a grupos de investigação desde os meus anos de graduação, acredito que as comunidades científicas abertas têm o maior potencial para ter um impacto a longo prazo na nossa sociedade. Exemplos destas comunidades são The Turing Way e Pangeo, a primeira centrada numa audiência geral e a segunda na comunidade geocientífica. São comunidades que promovem uma visão da ciência em que qualquer pessoa pode contribuir para um objectivo comum, democratizando o conhecimento e as boas práticas em projectos em diferentes sectores produtivos. A Turing Way tem um canal de comunicação diversificado (ver detalhes aqui), mas o que aconselho em primeira instância é que se junte a Slack. Com cerca de 400 membros, este é o local onde se pode trocar ideias com todos os membros e conhecer as atividades da comunidade. Ao longo do ano, são organizadas, `, sessões de traço de livro` semanas, que são eventos do tipo hackathon em que são propostas várias actividades, tais como propor ou rever conteúdos do recurso em linha, pequenas conversas sobre vários tópicos científicos abertos e espaços de socialização ou de rede entre os membros. Ao contrário das tradicionais maratonas de hackathons, não há concurso para um prémio, qualquer contribuição faz parte de uma celebração comum. Através de The Turing Way, também tomei conhecimento do programa .Open Life Science (OLS). É outra comunidade que oferece 16 semanas de formação de liderança científica aberta. Participei na quarta coorte para validar a ideia do livro de ciência dos dados ambientais através de reuniões com o meu mentor. Subsequentemente, co-mentorei um projecto de conhecimento científico aberto multilingue na Ásia Central, no quinto coorte. Ambas as experiências foram valiosas, pois na primeira pude aprender os princípios básicos de liderar um projecto científico aberto, e depois devolver o que aprendi através do meu papel de mentor. Recomendo vivamente que se junte à OLS, eles estão abertos a qualquer ramo do conhecimento em que se queira praticar ciência aberta.

Resumo

Completamos a segunda prestação de Alejandro 101. Estou satisfeito por poder partilhar o meu desenvolvimento profissional e académico, bem como algumas oportunidades para aqueles interessados em ciência ambiental aberta e tecnologias da informação.

Gostaria de aproveitar esta oportunidade para indicar que, se o meu conteúdo for relevante, publicarei mensalmente (se a minha carga profissional e familiar actual o permitir) vários tópicos a partir de discussões de ferramentas (com código), bem como conceitos ou esquemas propostos em tópicos científicos, ambientais ou de tecnologia da informação abertos. De tempos a tempos partilharei uma visão ocasional da minha vida pessoal ou viagens que podem ser enriquecedoras para outros leitores deste blogue.

Para uma ciência inclusiva e transparente 🚀